Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem260Q8BMD6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem260Q8BMD6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms