Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tm2d3Q8BJ83 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms