Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdca8Q8BHX3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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