Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atg4bQ8BGE6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Atg4bQ8BGE6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg4bQ8BGE6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg4bQ8BGE6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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