Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8BGC1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8BGC1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8BGC1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms