Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Jmjd4Q8BFT6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms