Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpped1Q8BFS6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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