Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
H2-M10.4Q85ZW8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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