Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms