Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem39bQ810L4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem39bQ810L4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem39bQ810L4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem39bQ810L4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem39bQ810L4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem39bQ810L4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem39bQ810L4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem39bQ810L4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem39bQ810L4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem39bQ810L4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms