Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim19Q80ZU4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms