Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc28Q80XJ3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms