Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pcsk9Q80W65 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms