Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnupnQ80W37 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SnupnQ80W37 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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