Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrc1Q80VQ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms