Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms