Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Tnfsf18Q7TS55 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf18Q7TS55 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms