Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sbno2Q7TNB8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms