Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmc8Q7TN58 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmc8Q7TN58 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmc8Q7TN58 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmc8Q7TN58 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmc8Q7TN58 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmc8Q7TN58 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmc8Q7TN58 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms