Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HhipQ7TN16 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms