Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vma21Q78T54 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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