Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ubfd1Q78JW9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ubfd1Q78JW9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ubfd1Q78JW9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ubfd1Q78JW9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ubfd1Q78JW9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ubfd1Q78JW9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ubfd1Q78JW9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubfd1Q78JW9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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