Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ncapd3Q6ZQK0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms