Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf653Q6YND2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf653Q6YND2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms