Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb3Q6XAS4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssxb3Q6XAS4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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