Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc88cQ6VGS5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms