Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Timd4Q6U7R4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms