Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PdgfrlQ6PE55 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdgfrlQ6PE55 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms