Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf1cQ6PDZ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms