Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ6

Fbxo42, F-box only protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo42Q6PDJ6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fbxo42Q6PDJ6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fbxo42Q6PDJ6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms