Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mfsd13aQ6PDE8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms