Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd4aQ6PDC8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms