Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Trak1Q6PD31 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trak1Q6PD31 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms