Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Herc4Q6PAV2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Herc4Q6PAV2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 401.7 ms