Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gapvd1Q6PAR5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gapvd1Q6PAR5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms