Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AtminQ6P9S1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms