Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hdac10Q6P3E7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hdac10Q6P3E7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hdac10Q6P3E7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdac10Q6P3E7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms