Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1Q6NXH3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1Q6NXH3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms