Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms