Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hecw2Q6I6G8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw2Q6I6G8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms