Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hist2h2aa1Q6GSS7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms