Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca2Q6DIC0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca2Q6DIC0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms