Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms