Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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Pdzrn3Q69ZS0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Pdzrn3Q69ZS0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Pdzrn3Q69ZS0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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