Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Jmjd1cQ69ZK6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Jmjd1cQ69ZK6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Jmjd1cQ69ZK6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Jmjd1cQ69ZK6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Jmjd1cQ69ZK6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jmjd1cQ69ZK6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Jmjd1cQ69ZK6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Jmjd1cQ69ZK6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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