Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CltcQ68FD5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltcQ68FD5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms