Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sbno1Q689Z5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms