Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CilpQ66K08 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms