Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp9Q64HY3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp9Q64HY3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms