Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Defa17Q64016 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Defa17Q64016 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Defa17Q64016 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Defa17Q64016 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Defa17Q64016 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Defa17Q64016 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Defa17Q64016 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Defa17Q64016 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa17Q64016 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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